Вход

ВКР Исследование особенностей построения моделей машинного обучения на малых наборах данных в биомедицине

Рекомендуемая категория для самостоятельной подготовки:
Дипломная работа*
Код 525585
Дата создания 2023
Мы сможем обработать ваш заказ (!) 6 мая в 16:00 [мск]
Файлы будут доступны для скачивания только после обработки заказа.
2 930руб.
КУПИТЬ

Описание

На 1 февраля 2023 года оригинальность более 80%

Могу проверить вам актуальную оригинальность работы при покупке, пишите в личку.


Оригинал документа в pdf, конвертация в Word автоматическая (в word могут быть недочеты, которые вы легко исправите самостоятельно)

В данной работе были рассмотрены проблемы при работе с наборами данных в биомедицине, которые затрудняют применение классических моделей машинного обучения. Этот список проблем включает ограниченность по размеру, несбалансированность классов, пропущенные значения, большое количество признаков и другие. В ходе исследования были выведены инструменты для их решения и также описано их влияние на различные модели, которые применяются для решения задач классификации, кластеризации и регрессии.

В ходе разработки программного кода были построены модели машинного обучения с применением описанных инструментов. Для написания кода был использован язык программирования Python, который является одним из основных инструментов для осуществления интеллектуального анализа данных.


В современном мире существует необходимость хранения и обработки

огромного количества информации и данных. Аналитики и исследователи изучают данные, с целью найти возможные закономерности и зависимости между различными показателями. Благодаря увеличению вычислительной мощности, памяти и способности генерации ошеломляющих объемов данных компьютеры используются для выполнения широкого спектра сложных задач, с которыми им удается справляться с впечатляющей скоростью и точностью. Машинное обучение – один из наиболее значимых инструментов, который помогает продвигать прогресс в развитии искусственного интеллекта, а также участвует в работе с данными и их анализе.

Основным инструментом машинного обучения, как научной области, является статистика. Статистические методы помогают осуществлять разработку проектов прогнозного моделирования, а также интерпретировать результаты полученной модели. Машинное обучение также включает в себя и математику и компьютерные науки. Фундаментальные математические знания важны, чтобы анализировать результаты применения алгоритмов обработ-ки данных, и, в частности, для понимания алгоритмов построения классификаторов. А компьютерные науки используются непосредственно как инструмент для построения моделей машинного обучения.

Машинное обучение широко используется как в научных кругах, так и в таких прикладных предметных областях: фондовые, валютные рынки, демография, маркетинг, бизнес, банковская система. На данный момент практически любая область требует использования анализа данных и методов машинного обучения для стимулирования разработки «интеллектуальных продуктов», способных делать точные прогнозы с использованием различных источников данных.

В нашей работе мы рассмотрим одну из важнейших областей, где применяется машинное обучение и интеллектуальный анализ данных -биомедицина. Биомедицина – это раздел медицины, изучающий организм человека с точки зрения теории, его строение, функции в состоянии болезни, их диагностики, коррекции и лечения. В биомедицине так же собираются данные о пациентах, начиная от анализов крови, заканчивая томографией мозга. В совокупности некоторый набор показателей может напрямую сказываться на факторы появления конкретной болезни, а также, возможность выявления высокого риска возникновения неотложных медицинских ситуаций, таких как рецидив или переход в другое болезненное состояние. Благодаря возможности комплексного анализа существующих данных область биомедицины может выйти на совершенно новый уровень и открыть новые методы для лечения болезней и их избежание.

В частности, применение машинного обучения в биомедицине способно решить следующие задачи:

• Определить вид заболевания

• Выбрать оптимальную стратегию лечения

• Спрогнозировать развития болезни

• Вычислить риск возможных осложнений в будущем

• Выявить синдромы и признаки определенной болезни

Содержание

Содержание ........................................................................................................................ 3 Введение ............................................................................................................................. 4 1. Теоретический аспект проблемы малого набора данных ....................................... 8

1.1 Необходимые сведения из машинного обучения .................................................. 8 1.2 История применения машинного обучения в биомедицине .............................. 12 1.3 Основные проблемы работы с малыми наборами данных в биомедицине ...... 15

2. Основные подходы для работы с малыми наборами данных .............................. 24 2.1 Алгоритмы работы с данными .............................................................................. 25 2.2 Показатели точности модели ................................................................................ 33 2.3 Инструменты для решения проблем малого набора данных ............................. 38

3. Применение иструментов по работе с малыми наборами данных ...................... 46 3.1 Обучение моделей .................................................................................................. 46 3.2 Результаты ............................................................................................................... 59

Заключение ....................................................................................................................... 61 Список используемой литературы ................................................................................. 62 Приложения...................................................................................................................... 65

Список литературы

1. Rong, G. Artificial Intelligence in Healthcare: Review and Prediction Case

Studies. / G. Rong, A. Mendez, E.B. Assi, B. Bo Zhao, M. Sawan // Engineering 6 (2020) 291-301

2. Sidey-Gibbons, J.A.M. Machine learning in medicine: a practical introduction /

J. A.M. Sidey-Gibbons, C.J. Sidey-Gibbons // Sidey-Gibbons and Sidey-Gibbons BMC Medical Research Methodology (2019) 19:64

3. Forman, G. Learning from Little: Comparison of Classifiers Given Little Training. / G. Forman, I. Cohen// PKDD 2004, LNAI 3202, pp. 161–172, 2004.

4. Shaikhina, T. Machine Learning for Predictive Modelling based on Small Data in Biomedical Engineering. / T. Shaikhina, D. Lowe, S. Daga, D. Briggs, R.

Higgins, N. Khovanova.// IFAC-PapersOnLine 48-20 (2015) 469–474

5. Tanwani, A.K. Guidelines to Select Machine Learning Scheme for

Classification of Biomedical Datasets. /A.K. Tanwani, J. Afridi, M.Z. Shafiq, M. Farooq// EvoBIO 2009, LNCS 5483, pp. 128–139, 2009.

6. Segovia, F. Multivariate analysis of dual-point amyloid PET intended to assist

the diagnosis of Alzheimer’s disease. /F. Segovia, J. Ramírez, D. Castillo-Barnes, D. Salas-Gonzalez, M. Gómez-Río, P. Sopena-Novales, C. Phillips, Y. Zhang, J.M. Górriz// Neurocomputing 417 (2020) 1-9.

7. Su, C. Mining genetic and transcriptomic data using machine learning approaches in Parkinson’s disease./ C. Su, J. Tong, F. Wang// npj Parkinson’s

Disease (2020) 6:24

8. Jubair, S. A novel approach to identify subtype-specifc network biomarkers

of breast cancer survivability. / S. Jubair, A. Alkhateeb, A.A. Tabl, L. Rueda,

A. Ngom //Network Modeling Analysis in Health Informatics and Bioinformatics (2020) 9:43

9. Schperberg, A.V. Machine learning model to predict oncologic outcomes for

drugs in randomized clinical trials. Int. J. Cancer. / A.V. Schperberg, A. Boichard, I.F. Tsigelny, S.B. Richard, R. Kurzrock// 2020;147:2537–2549.

10. Sarrouti, M. A Machine Learning-based Method for Question Type Classification in Biomedical Question Answering. /M. Sarrouti, S.O.E. Alaoui//

Methods Inf Med 2017; 56: 209–216.

11. Nguyen, D.H. Recent advances and prospects of computational methods for

metabolite identification: a review with emphasis on machine learning approaches. /D.H. Nguyen, C.H. Nguyen, H. Mamitsuka// Briefings in Bioinformatics, 20(6), 2019, 2028–2043.

12. Tran, T. Risk stratification using data from electronic medical records better predicts suicide risks than clinician assessments. /T. Tran, W. Luo, D. Phung,

R. Harvey, M. Berk, R.L. Kennedy, S. Venkatesh // Tran et al. BMC Psychiatry 2014, 14:76.

13. Foster, K.R. Machine learning, medical diagnosis, and biomedical engineering research – commentary. /K.R. Foster, R. Koprowski, J.D Skufca// Foster et al. BioMedical Engineering OnLine 2014, 13:94.

14. Podgorelec, V. Decision Trees: An Overview and Their Use in Medicine. /V. Podgorelec, P. Kokol, B. Stiglic, I. Rozman // Journal of Medical Systems, Vol.

26, No. 5, October 2002

15. Bone, D. Applying Machine Learning to Facilitate Autism Diagnostics: Pitfalls

and Promises. / D. Bone, M.S. Goodwin, M.P. Black, C. Lee, K. Audhkhasi, S.Narayanan// J Autism Dev Disord (2015) 45:1121–1136

16. Campbell, C. Machine Learning Methodology in Bioinformatics. / C. Campbell

// Springer Handbook of Bio- / Neuroinformatics (2014) 185:206

17. Steyerberg, E.W. Internal and external validation of predictive models: A

simulation study of bias and precision in small samples. / E.W. Steyerberg, S.E. Bleeker, H.A. Moll, D.E. Grobbee, K.G.E. Moons // Journal of Clinical Epidemiology 56 (2003) 441–447.

18. Zitnika, M., Nguyenb, F., Wang, B., Leskovec, J., Goldenberg, A., Hoffman,

M.M. Machine Learning for Integrating Data in Biology and Medicine: Principles, Practice, and Opportunities. /M. Zitnika, F. Nguyenb, B.Wang, J.

Leskovec, A. Goldenberg, M.M. Hoffman //Information Fusion 50 (2019) 71:91

19. Holder, L.B. Machine learning for epigenetics and future medical applications.

/L.B. Holder, M.M. Haque, M.K. Skinner //ISSN: 1559-2294 (Print) 1559-2308.

20. Habr.com: сайт. – URL: https://habr.com/ru/post/470650/ (дата обращения

01.03.2021)

Очень похожие работы
Пожалуйста, внимательно изучайте содержание и фрагменты работы. Деньги за приобретённые готовые работы по причине несоответствия данной работы вашим требованиям или её уникальности не возвращаются.
* Категория работы носит оценочный характер в соответствии с качественными и количественными параметрами предоставляемого материала. Данный материал ни целиком, ни любая из его частей не является готовым научным трудом, выпускной квалификационной работой, научным докладом или иной работой, предусмотренной государственной системой научной аттестации или необходимой для прохождения промежуточной или итоговой аттестации. Данный материал представляет собой субъективный результат обработки, структурирования и форматирования собранной его автором информации и предназначен, прежде всего, для использования в качестве источника для самостоятельной подготовки работы указанной тематики.
bmt: 0.00386
© Рефератбанк, 2002 - 2024