Классы микроорганизмов. Бактерии

Классы микроорганизмов. Бактерии ...

Оглавление
Введение
Семейство Rhodospirillaceae
Род I. Rhodospirillum
Род II. Azospirillum
Род III. Levispirillum
Род IV. Magnetospirillum
Род V. Phaeospirillum
Род VI. Rhodocista
Род VII. Rhodospira
Род VIII. Rhodovibrio
Род IX. Roseospira
Род X. Roseospirillum
Род XI. Skermanella
Род XII. Sporospirillum
Семейство. Cystobacteraceae
Род I. Cystobacter
Род II. Archangium
Род III. Hyalangium
Род IV. Melittangium
Род V. Stigmatella
Заключение
Список использованной литературы

рассмотреть классы.

[1] Это позволяет им ориентироваться относительно магнитного поля Земли и опускаться на дно водоёма, где понижена концентрация кислорода (магнитотаксис). Схожие цепочки магнетита были найдены в Марсианских метеоритах, что вполне можно счесть доказательством существования там жизни. Род VI. RhodocistaКлетки vibrioid по спирали в форме, подвижные с помощью длинного полярного жгутика. Грамотрицательные. Относятся к Alphaproteobacteria.Внутренние фотосинтетических мембран происходит в ламелями лежал параллельно с цитоплазматической мембраной. Фотосинтетического пигмента являются бактериохлорофилла и каротиноидов из spirilloxanthin серии. Убихинон с девятью изопрена единиц (Q-9) присутствует.Клетки растут преимущественно photoheterotrophically в бескислородных условия на свет. Хемотрофных ростав условиях кислородной в темноте возможно.При выращивании в жидкой культуре, Р. centenaria клетки подвижны по помощью одного полярного жгутика (Favinger и соавт., 1989). На твердых сред, однако, многочисленные боковые, перитрихиальных жгутиков, что обеспечения быстрого передвижения по поверхности агара производят. Вид роения подвижность наблюдается с Р. centenaria еще не было наблюдается и в других фототрофных пурпурных бактерий несерных, и позволяет очень быстрое направленного света подвижность всей поверхности агара, который, кажется, истинное поведение phototactic являются бактериохлорофилла (этерифицированные фитолом) и каротиноиды ряда spirilloxanthin. Spirilloxanthin не является , но биосинтетических предшественников ликопин и rhodopin присутствуют в качестве основных компонентов.Клетки растут преимущественно под photoheterotrophically бескислородных условиях в свет с различными органическими соединениями как углерод и электронных источников. Хемотрофных рост при очень низкой напряженности кислорода возможно. Не удается адаптироваться к условиям кислородной роста. В microoxic условияхСульфат может быть использован в качестве единственного источника серы. Для оптимальной развития, добавление аскорбиновой кислоты или тиогликолят как восстановителя может быть необходимым. п-аминобензойной кислоты требуетсяв качестве фактора роста.Мезофильные бактерии пресной воды с оптимальным ростом при 25-30 ° С и рН 7,3 (диапазон рН: 6,0-8,5)?. Места обитания: застойные и бескислородных обитания пресноводных, которые подвергаются воздействию светом.Клетки vibrioid по спирали формы, 0.7-1.0? 4-6 лм или даже дольше, один полный оборот спирали 1.5-2.5 лм в ширину. Внутренние фотосинтетических мембранах присутствуют как пластинчатые стеки формирования под острым углом к ​​цитоплазматической мембраны Анаэробные жидких культур коричнево-оранжевого до красно-коричневый или темно-коричневый. Максимумы поглощения. Клетки жизни являются на 375, 465, 488-491, 520-528, 590 - 595, 803-807, 850-855 нм и. Фотосинтетического пигмента являются бактериохлорофилла (этерифицированные фитолом) и каротиноидов из серии spirilloxanthin. Spirilloxanthin неявляется, но биосинтетических предшественников ликопин и rhodopin присутствуют в качестве основных компонентов. Клетки растут преимущественно photoheterotrophically в бескислородных условиях в свете различных органических соединений углерода и источников электронов. Хемотрофных роста при очень низких кислорода напряженность возможна, но способность адаптироваться к кислородной роста условия отсутствуют. В microoxic условиях клетки полностью пигментированные. Аммиак, N2, и некоторые аминокислоты использованы в качестве источников азота. Для оптимального развития того аскорбиновой кислоты или тиогликолят в качестве восстановителя может быть необходимо. Сложные смеси аминокислот, таких как дрожжи извлечь и витаминно-бесплатная казаминовой кислоты, стимулируют рост значительно и может потребоваться.Мезофильные бактерии пресной воды с оптимальным ростом на 30 ° С и рН 7,3 (диапазон рН: 6,0-8,5)?. Места обитания: застойные и бескислородных обитания пресноводных, которые подвергаются воздействию света.Поток необходимой для фото-тактического реагирования, и что фототаксис находится под контролем дыхания (Romagnoli и соавт., 1997). тип деформации (ATCC 43720), не phototactically активных (Nickens и соавт., 1996).Спектры поглощения анаэробных культур, выращенных в свете или аэробно в темноте почти идентичны, что свидетельствует о отсутствие кислорода репрессий фотопигмент синтеза которая является общей для большинства аноксигенных фототрофных пурпурных бактерий.Из 13 штаммов под следствием, все были чувствительны к рифампицин и стрептомицин, но весьма устойчивы к неомицин и канамицин (Nickens и соавт., 1996).Обогащение и процедуры изоляции Р. centenaria по-видимому, широко распространены в теплых водах и неоднократно выделяли из различных горячих источников сТемпература исходной воды между 34 и 58 ° С (Nickens и др. др.., 1996). Большинство штаммов были изолированы с тетраоксидом в качестве единственного источника азота и в бескислородных условиях, но после переходного контакта с воздухом. Инкубация при температуре от 40 и 45 ° С в анаэробных условиях на свету, в средствах массовой информации подходящую для пресноводных пурпурных бактерий несерных, и с N2 в качествеЕдинственным источником азота, обеспечивает избирательное условия для обогащения из Rhodocista centenaria (Nickens и соавт., 1996). Стандарт методы для выделения анаэробных бактерий в разведения в агаре ряда и агара могут быть применены (Biebl и пфеннига, 1981; Имхофф и Tru ¨ в, 1992).Культуры хорошо сохранились по стандартным методикам в жидком азоте, путем лиофилизации или хранения при? 80? C в механическом морозильник.Род VII. RhodospiraЖгутики и размножаются делением. Грамотрицательные. Принадлежать Alphaproteobacteria. Внутренние фотосинтетической мембраны из везикулярного типа. Фотосинтетическая пигменты бактериохлорофилла и каротиноидов. Menaquinones и убихиноны с семь единиц изопрена (MK-7 и Q-7) присутствуют. Основные сотовые жирные кислоты C18: 1 и С16: 0, С18: 1 доминирующим компонентом ( 60% от общего количества жирных кислот).Клетки растут преимущественно photoheterotrophically в бескислородных условия в свет, но слабый рост также может быть возможным под microoxic условиях в темноте. Факторы роста не требуется.Морские бактерии требуют соли для роста.Места обитания: солончак отложений и ламинированные коврики микроорганизмов.Типичный вид: Rhodospira trueperi Pfennig, Lu.nsdorf, Su.ling и Имхофф 1998 года, 328 (эффективная публикации: Pfennig, Lu.nsdorf, Su.ling и 1997 Имхофф, 44).В настоящее время Rhodospira trueperi является единственным представителем этого рода. Р. trueperi был выделен из плоского ламинированного микробной мат в солончаках недалеко Woods Hole, штат Массачусетс, США. спиралевидные бактерии очень подвижная, имеет биполярную пучки жгутиков, и внутренних фотосинтетических мембран везикулярного типа. Основные фотосинтетических пигментов бактериохлорофилла и каротиноидов tetrahydrospirilloxanthin. Р. trueperi, морской организма, показывает оптимальный рост в присутствии соли. Это использует ряд органических субстратов, как углерод и энергия источников, и требует витаминов и сульфидов в восстановленной серы источником для роста. В присутствии сульфида, S0 глобул, образованных за пределами клетки. S0 не далее окисляется до сульфатов.По гену 16S рРНК последовательности анализа, Rhodospira trueperi наиболее близок к Roseospira mediosalina. Филогенетического отношения этих бактерий на основе последовательностей 16S рДНК Rhodospira trueperi был изолирован от микробного мата в соли болоте, требует соли для роста, и зависит от наличия сульфидов в питательной среде (Pfennig и соавт., 1997). Стандартные методы для выделения анаэробных бактерий в агар серии разбавления может быть применен для Rhodospira видов (Biebl и пфеннига, 1981;Имхофф, 1988; Имхофф и Tru.per, 1992), если приняты меры, чтобы установить и поддерживать бескислородных условиях. Rhodospira trueperi могут быть выращены на Pfennigы среды для пурпурных серных бактерий с добавлением 2% NaCl и витамины (Или дрожжевого экстракта).Культуры могут быть сохранены с помощью стандартных методик в жидком азоте или 80 C в механической морозильной камере.Rhodospira виды характеризуются соль требованиям типичных морских бактерий, требования к сульфида в качестве восстановленной серы Источник, необычные спектры поглощения из-за присутствия бактериохлорофилла и присутствие menaquinones с семи единиц изопрена. Род VIII. RhodovibrioРод Vibrio семейства Vibrionaceae отдела Gracilicutes образуют прямые или изогнутые подвижные палочки; подвижность обусловлена одним или несколькими жгутиками.Снаружи бактерии рода вибрио покрыты оболочкой, образованной выростом наружного слоя клеточной стенки.Бактерии рода Vibrio хемоорганотрофы; большинство видов оксидаза-положительно.Микроорганизмы рода вибрио чувствительны к вибриостатику 0/129 (2,4-диамино-6,7-диизопропилптеридин). Ионы Na+ стимулируют рост всех видов и необходимы для культивирования некоторых видов. Вибрионы распространены не только в пресных, но и солёных водоёмах, особенно в эстуариях рек.Бактерии рода вибрио покрывают дно, растительность и колонизируют организмы водных животных. Некоторые виды патогенны для водных беспозвоночных и позвоночных животных; часть вибрионов также патогенна для человека. Наибольшее медицинское значение имеют V. choterae, V. parahaemolyticus и V. vulnificus.Клетки vibrioid на спиральные, подвижные посредством полярного жгутики и размножаться делением. Грамотрицательные, принадлежащих в Alphaproteobacteria. Внутренние фотосинтетических мембран присутствуют в виде пузырьков. Фотосинтетическая пигменты бактериохлорофилла и каротиноидов из серии spirilloxanthin. Убихиноны и menaquinones с 10 единиц изопрена (Q-10 и MK-10) присутствуют. Основные сотовые жирные кислоты C18: 1 и C18: 0.Клетки растут преимущественно photoheterotrophically в бескислородных условия на свет. Хемотрофных роста возможно при microoxic к кислородной условиях в темноте. Комплекс питательных веществ требуется. Галофильных бактерий, которые требуют NaCl или морской соли для рост и есть соль оптимумов выше солености морской воды. Места обитания: бескислородных зоны гиперсоленых средах, таких как солеварни и соли озерах, которые подвергаются воздействию света.Типичный вид: Rhodovibrio salinarum (Nissen и Dundas 1985)Рост видов Rhodovibrio зависит от концентрации гиперсоленых солей. Оба вида хорошо растут в 2 М NaCl. Они показывают, лучший рост в присутствии 0,1 М Mg2? и может расти в средства массовой информации, содержащего 1 М MgCl2 (Mack и соавт., 1993). В отличие от Р. sodomensis, который устойчив к NaBr до концентрации 1,5 М, рост Р. salinarum подавляется при гораздо более низких концентрациях из NaBr (Mack и соавт., 1993). В ответ на внешние солености, глицин бетаин и эктоина накапливаются как главные и второстепенные компоненты, соответственно, совместимы растворенных веществ Rhodovibrio видов характеризуются их требования высокие концентрации соли и сложные питательные вещества. Таким образом, комплекс средах с солью концентрации 10% и анаэробной инкубацииВ свете обеспечивает селективное условия для обогащения Rhodovibrio из вида. Стандартные методы для изоляции анаэробных бактерий в агар серии разбавления и на чашках с агаром может быть применен для вида Rhodovibrio.Среда Ниссен и Dundas (1984) является подходящими для роста Rhodovibrio salinarum, а также может быть использована для sodomensis Rhodovibrio. Культуры могут быть сохранены с помощью стандартных методик в жидком азоте, путем лиофилизации или хранения при 80 C в механическом морозильник.Род IX. RoseospiraКлетки vibrioid на спиральные, подвижные посредством полярного жгутики и размножаться делением. Грамотрицательные, принадлежащих в Alphaproteobacteria. Внутренние фотосинтетических мембран присутствуют в виде пузырьков. Фотосинтетическая пигменты бактериохлорофилла и каротиноидов из серии spirilloxanthin.Клетки растут преимущественно photoheterotrophically в бескислородных условия на свет. Хемотрофных роста возможно при microoxic условиях в темноте. Факторы роста не требуется.Галофильных бактерий, которые требуют NaCl или морской соли для роста.Места обитания: теплые серный источник с повышенной концентрацией минеральных солей.Типичный вид: Roseospira mediosalina (Компанцева и Горленко 1984) Имхофф, Петри и Сулин 1998 года, 798 ("Rhodospirillum mediosalinum "Компанцева и Горленко, 1984, 780.)Roseospira mediosalina был изолирован от микробных матах теплой серный источник (43-51 ° С) с повышенной концентрацией минеральных солей (2% от общего объема соли) и щелочной (рН 8,2) (Компанцева и Горленко, 1984). Средства массовой информации и условий роста применяется для Rhodospirillum виды пригодны также для видов Roseospira, в случае необходимости концентрации соли входят в комплект. Рецепт для минеральногоСоли среду, которая может быть использована, если 5% NaCl добавляется, дается с описанием рода Rhodospirillum. Стандартные методы для выделения анаэробных бактерий в агар серии разбавления и на агар может быть применен для вида Roseospira (Imhoff, 1988; Имхофф и Tru ¨ в, 1992). Roseospira mediosalina также может быть выращены на среде Pfennig 'с для пурпурных серных бактерий (см. Род СНготаИит) с добавлением 5% NaCl и витаминыКультуры могут быть сохранены с помощью стандартных методик в жидком азоте, путем лиофилизации или хранения при 80 C в механическом морозильник.Благодаря своей форме спирали и фототрофных мощности, Roseospira виды были первоначально назначены Rhodospirillum рода, хотя ДНК гомологии с было незначительным (Компанцева и Горленко, 1984). С ростом признания высокая фенотипическая и хемотаксономических разнообразие спиралевидные фототрофных Alphaproteobacteria и большое генетическое расстояние между большинством из этих бактерий (Kawasaki и соавт., 1993b), перестановки из видов этой группы стало необходимым (Imhoff и соавт., 1998). Большие различия между Roseospira и Rhodospirillum привело к их классификации (Imhoff и соавт., 1998).Род X. RoseospirillumКлетки vibrioid на спиральные, подвижные посредством полярного жгутики и размножаться делением. Грамотрицательных и принадлежат в Alphaproteobacteria. Внутренние фотосинтетических мембран присутствуют в виде пластинчатых стеки. Фотосинтетическая пигменты бактериохлорофилла и каротиноидов.Клетки растут photolithoautotrophically и photoheterotrophically в бескислородных условиях на свету. Хемотрофных ростаМожно под microoxic условиях в темноте. Факторы роста не требуется. Морские бактерии, которые требуют NaCl или морской соли для оптимального роста.Места обитания: морские отложения и микробных матах.Типичный вид: Roseospirillum parvum Glaeser и Overmann 2001, 793 (эффективная публикации: Glaeser и Overmann 1999 года)Обогащение и процедуры изоляцииСредства массовой информации и условий роста применяется для Rhodospirillum видов также подходит для Roseospirillum вида, в случае необходимости концентрации соли входят в комплект. Рецепт среде минеральных солей, которые может быть использована, если 1-2% NaCl добавляется дается с описанием рода Rhodospirillum. Стандартные методы для изоляции анаэробных бактерий в агар серии разбавления и на агар может быть применены (Imhoff, 1988; Имхофф и Tru.per, 1992).Культуры могут быть сохранены с помощью стандартных методик в жидком азоте, путем лиофилизации или хранения при 80 C в механическом морозильник.Клетки vibrioid по спирали формы, 0.4-0.6? 1.8-2.6 лм, подвижные с помощью жгутиков биполярных и умножить на двоичном делении. Внутренние фотосинтетических мембранах присутствуют как ламели. Цвет клеточной суспензии розового до розовато-красного цвета. Максимумы поглощения живых клетках происходят при 380, 492, 515, 549, 595, 806, и 911 нм. Фотосинтетическая пигменты бактериохлорофилла и каротиноиды spirilloxanthin и lycopenal.Photolithoautotrophic рост происходит с сульфидов и тиосульфата. Сульфид окисляется до элементарной серы, которая является хранение вне клеток, а не далее окисляется до сульфатов.В присутствии сульфидов и бикарбоната, ацетата, пропионат, бутират, валерат, оксоглутарат, пирувата, лактата, сукцинат, фумарат, малат, фруктоза, казаминовой кислоты, дрожжевой экстракт, L-аланин и L-глутамата были ассимилированы.Хемотрофных роста возможна при условиях microoxic в темное время суток (с тиосульфатом или с тиосульфатом и ацетат). Неспособные сульфатредукции ассимиляционных. ДрожжиЭкстракт обязана поставлять факторов роста.Морские бактерии с оптимальным ростом на 30 ° С, рН 7,9, и концентрации 1-2% NaCl (диапазон: до более чем 6% NaCl).Места обитания: микробные маты Великой Sippewissett Salt Marsh.G мол% С ДНК: 71.2 (ВЭЖХ).Вид деформации: 930i, DSM 12498.Род XI. SkermanellaГрамотрицательные, с одноклеточных и многоклеточных фазы роста. Не образует спор. Одноклеточные клетки фазы стержня формы, с округлыми или коническими концами и прямыми или изогнутыми оси.Подвижные с одним полярным жгутиком и одним или несколькими боковыми жгутиками различных длин волн. Многоклеточные конгломератов фазу возникают из клеток, которые теряют подвижность, становятся оптически преломляющие свет, и размножаются многоплоскостной septation. Нет нитевидные структуры или почки образуются. Chemoorganotrophic облигатно и факультативно анаэробные, имеющих ферментативные обмена веществ. Принадлежит к Alphaproteobacteria.Типичный вид: Skermanella parooensis (Skerman, Sly и Уильямсон 1983) Sly и 1999 Stackebrandt, 543 (Conglomeromonas largomobilis подвид. parooensis Skerman, Sly и Williamson 1983)Колонии apricotcolored, т непрозрачной, круглый, и вырос, с шероховатой поверхностью и нерегулярные края после 72 ч при 28 ° С. Конгломераты сухой внешний вид и трудно эмульсию. СливнойРост одного клеток слизистого и эмульсию легко. Конгломераты имеют такие же или большего диаметра колонии от одноклеточных форм. Колонии, выращенные в присутствии Конго красный не густо покраснеть. Старение клетки содержат поли-bhydroxybutyrate включений. Оптимальная температура: 28 С; Диапазон 10-37 ° С. Рост происходит на пептон дрожжевого экстракта агара, 0,1% агар, глюкозо-сульфат аммония агар, цитрат-аммиачном агаре, и озерной воды агар. Замедление роста происходит в присутствии 2% NaCl в конгломерате формы. Нет росту в присутствии 5% NaCl. Каталазы, оксидазы, аминопептидазы, фосфатазы, дезоксирибонуклеазы, и уреазы производятся. Нитраты сводится к нитриты. Использует цитрат и малоната. Гидролизует Tween 80, но не эскулин, хитин, альгинат, целлюлозу, желатин, или казеин. Кислота, но не газ из целлобиоза, галактоза, глюкоза, инозит, лактозу, маннита, маннозы, мелибиозы, и рамнозы. Штамм был выделен из пресной воды.Род XII. SporospirillumЖесткая, винтовой бактерий огромных размеров, 1.8-4.8 лм в диаметре и 40-100 лм в длину. Структуры, которые морфологически похожи эндоспоры происходят в клетках, но их тепловое сопротивление не была определена. Споро-подобные структуры имеют возможность поворота и мигрировать в цитоплазме бактерии. Они изначально развиваются вблизи полюсов клетки, а затем мигрировать к центру, где они будут освобождены после того, как ячейки разрывами и распадается. Грамм реакции не было сообщается. Клетки подвижные, но не органов движения являются очевидной. Отношения между клетками кислорода неизвестно.Происходят в кишечном содержимом головастиков. Не были выделены.Штамм не был назначен.Семейство. Cystobacteraceae Род I. CystobacterРод получил такое название, благодаря способности утилизировать цитрат натрия и использовать его в качестве единственного источника углерода.Многими авторами показана этиологическая роль бактерий этого рода в патологии человека. Наиболее часто описаны Citrobakter как этиологические агенты различных кишечных заболеваний, носящих характер вспышек и спорадических случаев : от диспепсий и гастроэнтероколитов до пищевых отравлений. Некоторые авторы отмечают частое обнаружение Citrobacter от лиц с диагнозом "клиническая дизентерия".Имеются сведения об этиологической роли Citrobacter при циститах, пиелитах, холециститах, менингитах, отитах, остеомиелитах.