Рекомендуемая категория для самостоятельной подготовки:
Дипломная работа*
| Код |
265150 |
| Дата создания |
01 июня 2015 |
| Страниц |
61
|
Мы сможем обработать ваш заказ (!) 18 ноября в 12:00 [мск] Файлы будут доступны для скачивания только после обработки заказа.
|
Описание
2009 год, Новосибирск - на отлично
Вкратце: в основе работы лежит case-control исследование предрасположенности к раку молочной железы в связи с носительством определенных мутаций
...
Содержание
СОДЕРЖАНИЕ
Список используемых сокращений......................................................................3
ВВЕДЕНИЕ........................................................................4
I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ:
Глава 1. Исследование ассоциации полиморфизмов разной локализации с риском развития рака молочной железы ................................................................................6
Genome-wide association study...................................................... ........... 12
Глава 2. FGFR2, его структура, свойства и функции....................................................14
Глава 3. Влияние структурных изменений гена FGFR2 на его экспрессию.....................................................................17
3.1. Влияние структурных изменений гена FGFR2 на регуляцию транскрипции...................................................................17
3.2. Особенности регуляции альтернативного сплайсинга гена FGFR2...................19
Заключение.....................................................................24
II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ:
Глава 4. Материалы......................................................................25
Глава 5. Схема выполненного экспериментального исследования.........................26
Глава 6. Методы.........................................................................27
III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.....................................................................38
ВЫВОДЫ.........................................................................56
Список использованной литературы.....................................................................57
Введение
ВВЕДЕНИЕ
Рак молочной железы (РМЖ) является самой распространенной причиной смертности от онкологических заболеваний у женщин в возрасте 40-69 лет. Около 30-ти % всех женских раковых опухолей - относятся к РМЖ [1]. Общий риск развития заболевания РМЖ в течение жизни составляет 1-10% [1], однако для женщин, имеющих родственников с РМЖ в первом поколении, риск увеличивается вдвое [2]. Подобная «семейная агрегация» случаев РМЖ обусловлена наличием генетической предрасположенности к заболеванию. На сегодняшний день известны некоторые из генов, мутации в которых связаны с высоким риском заболевания, в частности BRCA1, BRCA2, p53, CHEK2 [3-6] и некоторые другие. Однако наличие мутаций в этих генах объясняет лишь незначительную долю (менее 5%) от общего числа заболеваний.
В подавляющем большинст ве случаев предрасположенность к РМЖ формируется, как следствие аддитивного вклада полиморфизмов большого числа генов, каждый из которых оказывает незначительный эффект на увеличение риска РМЖ [7]. До недавнего времени исследования, направленные на определение генов, обуславливающих предрасположенность к РМЖ, были большей частью разрозненными, а их результаты противоречивыми. В 2007 г. были опубликованы результаты двух независимых исследований, в ходе которых на основании данных полногеномного скрининга были определены несколько полиморфных локусов, ассоциированных с риском заболевания РМЖ. В результате обоих исследований в числе локусов, показавших наибольшую ассоциацию с РМЖ, был идентифицирован интрон 2 гена FGFR2.
Фрагмент работы для ознакомления
e
Список литературы
Список использованной литературы
1. P.J. Willems. Susceptibility genes in breast cancer: more is less? // Clinical Genetics. - 2007. - N 72. - P.493-496.
2. Collaborative Group on Hormonal Factors in Breast Cancer. Familial breast cancer: Collaborative reanalysis of individual data from 52 epidemiological studies including 58 209 women with breast cancer and 101 986 women without the disease // Lancet. - 2001. - N 358. - P.389–1399.
3. Y. Miki et al. A strong candidate for the breast and ovarian-cancer susceptibility gene BRCA1 // Science. - 1994. - N 266. - P.66–71
4. R. Wooster et al. Identification of the breast cancer susceptibility gene BRCA2 // Nature. - 1995. - N 378. - P.789–792.
5. J.E. Garber, A.M.Goldstein, et al. Follow-up study of twenty-four families with Li-Fraumeni syndrome // Cancer Res. - 1991. - N 51. - P.6094–6097.
6. H.Meijers-Heijboer et al. Low-penetrance susceptibility to breast cancer due to CHEK2(*) 1100delC in noncarriers of BRCA1 or BRCA2 mutations // Nat Genet. - 2002. - N 31. - P.55–59.
7. P.D. Pharoah, A.Antoniou, et al. Polygenic susceptibility to breast cancer and implications for prevention // Nat Genet. - 2002. - N 31 (1). - P.33 – 36.
8. Ю.С. Аульченко, Т.И. Аксенович. Методологические подходы и стратегии картирования генов, контролирующих комплексные признаки человека // Вестник ВОГиС. - 2006. - N 1 (10). - Стр.189-202.
9. J.A. Ioannidis. Common genetic variants for breast cancer: 32 largely refuted candidates and larger prospects // Journal of National Cancer Institute. - 2006. - N 19 (98). - P.1350-1353.
10. D.F. Easton, K.A. Pooley, et al. Genome-wide association study identifies novel breast cancer susceptibility loci // Nature. - 2007. - Advance online publication (doi: 10.1038/nature05887). - P.1-9.
11. D.J. Hunter, P. Kraft et al. A genome-wide association study identifies alleles in FGFR2 associated with risk of sporadic postmenopausal breast cancer // Nature. - 2007. - N 6 (39). - P.870-874.
12. L. Raskin, M. Pinchev, et al. FGFR2 Is a Breast Canaer Susceptibility Gene in Jewish and Arab Israeli Populations // Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. - 2008. - N 17 (5). - P.1060-1065.
13. J. Liang, P. Chen, et al. Genetic variants of fibroblast growth factor receptor 2 (FGFR2) contribute to susceptibility of breast cancer in Chinese women // Carcinogenesis. - Advance Access. - Oct.8, 2008. - P.1-28.
14. S.N. Stacey, A. Manolescu et al. Common variants on chromosome 5p12 confer susceptibility to estrogen receptor–positive breast cancer // Nature Genetics. - Advance online publication. - 2008. - P.1-4.
15. S. H. Nordgard, F.E. Johansen, et al. Genes harbouring susceptibility SNPs are differentially expressed in the breast cancer subtypes // Breast Cancer Research. - 2007. - N 9 (113). - P.1-2.
16. C.L. Chaffer, B. Dopheide, et al. Abberant growth factor receptor signalling in bladder and other cancers // Differentiation. - 2007. - N 75. - P.831-842.
17. A.B. Moffa, S.P. Ethier. Differential signal transduction of alternatively spliced FGFR2 variants expressed in human mammary epithelial cells // Journal of cellular physiology. - 2007. - N 210. - P.720-731.
18. T. Matsunobu, T. Ishiwata, et al. Expression of keratinocyte growth factor receptor correlates with expansive growth and early stage of gastric cancer // International Journal of Oncology. - 2006. - N 28. - P.307-314.
19. J.Y. Cha, Q.T. Lambert et al. Involvement of fibroblast growth factor receptor 2 isoform switching in mammary oncogenesis // Mol Cancer Res. - 2008. - N 6 (3). - P.435-445.
20. S. Park, J.-H. Kim, et al. Aberrant hypermethylation of the FGFR2 gene in human gastric cancer cell lines // Biochemical and Biophysical Research Communications. - 2007. - N 357. - P.1011-1015.
21. Y. Zhang, J. Zhang, et al. Role of epithelial cell fibroblast growth factor receptor substrate 2alfa in prostate development, regeneration and tumorgenesis // Development and desease. - 2008. - N 135 (4). - P.1-10.
22. Б.П. Копнин. Механизмы действия онкогенов и опухолевых супрессоров. Обзор. режим доступа: RosOncoWeb.Ru.
23. E. Tashiro, Y. Minato et al. Regulation of FGF receptor-2 expression by transcri[tion factor E2F-1 // Oncogene. - 2003. - N 22. - P.5630-5635.
24. S. Greenbaum, A.S. Lazorchak, et al. Differential functions for transcription factor E2A in positive and negative gene regulation in pre-B-lymphocytes // J Biol Chem. - 2004. - N 279 (43). - P.1-17.
25. K.B. Meyer, A.-T. Maia, et al. Allele-specific up-regulation of FGFR2 increases susceptibility to breast cancer // PloS Biology. - 2008. - N 6 (5). - P.1098-1103.
26. M.Garcia-Closas, P. Hall, et al. Heterogeneity of Breast Cancer Associations with Five Susceptibility Loci by Clinical and Pathological Characteristics // PLoS Genetics. -2008. - N 4 (4). - P. 1-10.
27. N. Tamaru, Y. Hishikawa, et al. Estrogen receptor-associated expression of keratinocyte growth factor and its possible role in the inhibition of apoptosis in human breast cancer // Laboratory Investigation. - 2004. - N 84. - P. 1460–1471.
28. T.R. Rebbeck, A. DeMichele, et al. Hormone-dependent effects of FGFR2 and MAP3K1 in breast cancer susceptibility in a population-based sample of post-menopausal African-American and European-American women // Carcinogenesis. -2009. - N2 (30). - P.269–274.
29. C. Sa´ez, A.C. Gonza´lez-Baena, et al. Expression of Basic Fibroblast Growth Factor and Its Receptors FGFR1 and FGFR2 in Human Benign Prostatic Hyperplasia Treated With Finasteride // The Prostate. - 1999. - N 40. - P.83–88.
30. M. Mohammadi, S.K. Olsen et al. Structural basis for fibroblast growth factor receptor activation // Cytokine & Growth factor Reviews. - 2005. - N 16. - P.107-137.
31. R.H. Hovhannisyan, C.C. Warzecha, et al. Characterization of sequences and mechanisms through which ISSE/ISS-3 regulates FGFR2 splicing // Nucleic Acid Research. - 2006. - N 34 (1). - P. 373-385.
32. R.H. Hovhannisyan, R.P. Carstens. A novel intronic cis-element, ISE/ISS3, regulates rat fibroblast growth factor receptor 2 splicing through activation of an upstream exon and repression of a downstream exon containing a noncanonical branch point sequence // Molecular and cellular biology. - 2005. - N 1 (25). - P.250-263.
33. A.P. Baraniak, E.L. Lasda, et al. A stem structure in fibriblast growth factor receptor 2 transcripts mediates cell-type specific splising by approximating intronic control elements // Molecular and cellular biology. - 2003. - N 24 (23). - P.9327-9337.
34. E. Buratti, F.E. Baralle. Influence of RNA secondary structure on the pre-mRNA splicing process // Molecular and cellular biology. - 2004. - N 24 (24). - P.10505-10514.
35. Z. Ahmed, A. C. Schuller, et al. Extracellular point mutations in FGFR2 elicit unexpected changes in intracellular signalling // Biochemical Journal. - 2008. - Published as manuscript (doi: 10.1042/BJ20071594).
36. C.B. Ambrosone. The promise and limitations of genome-wide association studies to elucidate the causes of breast cancer // Breast Cancer Research. - 2007. - N 9 (14). - P.1-3.
37. J. Novembre, T. Johnson, et al. Genes mirror geography within Europe // Nature. - 2008. - N 456 (7219). - P.274.
38. J.E. Wigginton, D.J. Cutler, et al. A note on exact tests of Hardy-Weinberg equilibrium // Am J Hum Genet. - 2005. - N 76 (5). - P. 887-93.
Пожалуйста, внимательно изучайте содержание и фрагменты работы. Деньги за приобретённые готовые работы по причине несоответствия данной работы вашим требованиям или её уникальности не возвращаются.
* Категория работы носит оценочный характер в соответствии с качественными и количественными параметрами предоставляемого материала. Данный материал ни целиком, ни любая из его частей не является готовым научным трудом, выпускной квалификационной работой, научным докладом или иной работой, предусмотренной государственной системой научной аттестации или необходимой для прохождения промежуточной или итоговой аттестации. Данный материал представляет собой субъективный результат обработки, структурирования и форматирования собранной его автором информации и предназначен, прежде всего, для использования в качестве источника для самостоятельной подготовки работы указанной тематики.
bmt: 0.00425